freee会計で売掛金を入力する方法｜売上・入金・消込の手順

freee会計で後払いの売上を入力するとき、勘定科目に売掛金を選ぶのか迷いませんか。通常は収入取引を「未決済」で登録し、入金後はその取引へ決済情報を追加します。未決済とは、代金をまだ受け取っていない状態です。

入力を担当する方向けに、売上の手動登録、銀行明細からの入金消込、振込手数料や一部入金の処理を解説します。消込は、請求に対応する入金を結び付ける操作です。元の取引へ入金を登録し、二重計上や残高ずれを点検する際に使ってください。

本記事は2026年10月26日時点で取得したfreee公式ヘルプに基づきます。メニュー名、画面、利用できる機能は法人・個人、プラン、権限、アップデートで変わる場合があります。消費税、源泉所得税、どの年度の売上にするか、訂正処理は税理士等へ確認してください。

freee会計の売掛金入力は「未決済取引」で行う

freee会計では、後払いとなる売上を「未決済の収入取引」として登録することで、会計上の売掛金と回収状況を同時に管理します。

売上発生時は未決済の収入取引

7月20日に11万円の売上が成立し、8月31日に入金予定となる例です。次の仕訳は、消費税を売上金額に含める税込経理で示しています。

日付	借方	貸方
7月20日	売掛金 110,000円	売上高 110,000円

売上の登録画面で指定するのは、収入、発生日、取引先、売上高、金額、未決済、決済期日です。未決済取引に基づいてfreeeが売掛金を計上するため、通常は借方の売掛金を直接入力しません。

入金時は元の取引へ決済登録

8月31日に11万円が銀行へ入金されたら、7月20日の未決済取引へ入金先口座、決済日、金額を登録します。会計上は次の仕訳です。

日付	借方	貸方
8月31日	普通預金 110,000円	売掛金 110,000円

決済情報が登録されると、未決済残高が減り、全額なら完了になります。

「売掛金」の取引を別に作らない

freee公式ヘルプは、取引登録で勘定科目「売掛金・未収入金・未収収益」等を通常は入力せず、未決済取引の決済で消し込む理由を説明しています。

入金時に直接「普通預金／売掛金」の仕訳だけを追加すると、会計残高が一見合っても、元の未決済取引が残り、債権債務管理が正しく行えないことがあります。

仕訳帳の売掛金残高と、個別取引の未決済残額を両方確かめましょう。帳簿上の売掛金が減っていても、元の取引が未決済のままなら、消込が済んでいない状態です。

売上日と入金日を分ける

請求書を発行してから後日入金される取引は、売上発生日と決済日を分けます。入金日に売上高を新規登録すると、発生日の売上と重複する場合があります。

売上計上日は契約、引渡し、検収、役務提供の完了等で判断します。年度をまたぐ売掛金の仕訳も確認してください。

売掛金を手動で登録する手順

後払い売上の手動登録では、収入・発生日・売上高・金額を入力し、決済ステータスを未決済にします。入力する場所は［取引入力］→［収入・支出形式（取引の一覧・登録）］です。

1. 取引の一覧・登録を開く

［取引入力］→［収入・支出形式（取引の一覧・登録）］を開き、新しい収入取引を作成します。取引登録の権限が付与されていない場合は、管理者へ権限の付与を依頼しましょう。

2. 収入と発生日を入力する

取引区分を収入とし、売上が成立した日を発生日にします。請求書発行日・入金予定日と異なる場合があります。

3. 勘定科目と取引先を選ぶ

通常の商品・サービス売上は、売上高等の収益科目へ登録します。取引先の登録は、未回収の検索や相手先別の残高確認にも役立ちます。

営業外の資産売却等は売掛金ではなく未収入金となる場合があります。取引の性質に合う科目を税理士へ確認します。

4. 金額・税区分・品目等を入力する

金額欄には消費税込みの取引金額を入力します。標準税率10％、軽減税率8％、非課税・不課税など、売上の内容に合う税区分を選び、複数税率がある請求は行を分けます。

品目、部門、メモタグ、備考等を自社の管理単位に合わせて登録すると、後の検索がしやすくなります。

5. 決済を「未決済」にする

入金前なら未決済を選び、決済期日を設定します。ここで決済済みにすると、まだ入金されていないのに売掛金が計上されない・回収済みとして扱われる可能性があります。

6. 登録後に仕訳と未決済一覧を確認する

取引詳細や仕訳帳で売掛金・売上高が計上されているか、未決済一覧に取引先、金額、期日が表示されるか確認します。

請求書から売掛金を登録する

freee請求書からfreee会計へ取引登録する方法もあります。新しい帳票機能の取引連携はfreee請求書のアドバンスプランが対象です。請求書を保存する操作と、会計取引を登録する操作を分けましょう。

請求書発行と未決済取引を連携する

freeeの売掛金管理ガイドは、請求書から未決済取引へ連携する流れを紹介しています。新しい帳票機能では、請求書の詳細で［取引登録］を選ぶか、作成時に［保存して取引を登録］を使います。現在の取引連携ヘルプに沿って、対象プランと登録状態を確認しましょう。

請求書を使わない場合も、取引の一覧・登録から未決済の収入取引を作成する方法です。請求書連携と同じ売上を重ねないようにしましょう。

「請求書作成」と「取引登録」の状態を確認する

請求書を保存しただけか、会計取引まで登録したかを確認します。請求書から取引を登録した後、同じ売上を手動登録すると二重になります。

次の3つを請求番号で照合します。

• 請求書のステータス
• freee会計の取引
• 未決済残高

請求日と売上日が違う場合

月末締め・翌月請求では、請求書発行日より前に売上が成立する場合があります。逆に前払い請求では、請求書発行時点で売上が成立していないことがあります。

取引連携の発生日には、帳票の請求日または発注日が自動入力されます。売上が成立した日と違う場合は、取引登録時に発生日を修正します。前受けなど収益計上の判断が必要な取引は、税理士等と処理を決めましょう。

外部請求システムと連携する場合

API、CSV、他サービス連携で取引を作成している場合、freeeの請求書機能や手入力を併用すると重複しやすくなります。

登録元を一つに決め、メモタグ等で「請求書連携」「手入力」「CSV」などを識別します。

入金を手動で消し込む

freee公式の未決済取引消込ヘルプは、取引の一覧・登録で決済状況を未決済に絞り、対象取引を選んで決済情報を登録する方法を案内しています。

1. 未決済取引を絞り込む

取引入力メニューの収入・支出形式で、検索条件の決済状況を未決済にします。取引先・金額・発生日・決済期日も、対象を探す手がかりです。

2. 対象の取引を開く

振込名義、金額、請求番号を照合し、消込対象の未決済取引を選びます。同額請求が複数ある場合は支払通知を確認します。

3. 入金先口座・決済日・金額を登録する

入金額が取引額と一致する場合、決済が行われた口座、日付、金額を指定して登録します。全額なら未決済残高は0円になります。

4. 仕訳とステータスを確認する

普通預金等が増え、売掛金が減り、対象取引が決済済みになったことを確認します。

「入金明細を登録した」だけで安心せず、元の未決済取引とひも付いたかを確認してください。

売掛金の消込では、請求・入金・差額を照合する一般手順を解説しています。

「自動で経理」で入金を消し込む

「自動で経理」は、取り込んだ銀行明細から取引や入金を登録するfreeeの機能です。口座同期または明細アップロードを済ませたら、入金明細を元の未決済取引へ結び付けましょう。

1. 銀行明細を取り込む

事業用口座を登録し、入金明細を取り込みましょう。口座同期の対象期間と未取得期間、重複アップロードの有無も確認が必要です。

2. 推測された未決済取引を確認する

「自動で経理」に未決済取引の候補が出たら、請求番号と対象月も照合しましょう。金額と名義が同じでも、別の請求への入金である可能性が残ります。

3. 未決済取引の消込を選ぶ

推測が不足・誤りの場合、明細詳細から「未決済取引の消込」を選び、対象取引を検索します。条件が厳しすぎて対象が表示されないときは絞り込みを見直します。

4. 金額一致を確認して登録する

複数請求、差額、部分入金の場合は内訳を調整し、画面上で入金明細と選択した決済額が一致していることを確認します。

自動登録ルールは例外を想定する

同じ取引先からの入金には、条件に合う明細を登録・推測する自動登録ルールを使えます。ただし「未決済取引の消込をする」ルールは、個人のスターター・スタンダード、法人の旧ミニマムでは利用できません。通常の消込と、消込を自動登録するルールを分けましょう。

振込手数料、源泉所得税、相殺、複数月のまとめ入金では、推測された請求と差額の内訳を確かめましょう。差額を自動で推測する幅にもプラン別の条件があります。月末は請求一覧と未決済残高を照合し、ルールで処理できなかった取引を拾います。

入金額が違う場合の処理

freee公式ヘルプは、取引金額と入出金額が違う場合を、手数料、部分入金、複数取引まとめ、その他差額に分けて案内しています。

振込手数料が差し引かれた

請求額15,000円から自社負担の手数料300円が引かれ、14,700円が入金された例です。手動消込の金額欄には、実際の入金額14,700円を入力します。「支払手数料として登録」にチェックを入れると、差額300円の仕訳が追加されます。

会計上の表示例は次のとおりです。

借方	金額	貸方	金額
普通預金 14,700円 支払手数料等 300円	合計15,000円	売掛金	15,000円

ただし、インボイス制度では売上値引等の対価返還として処理するか、課税仕入れとして処理するかで税区分と保存書類が変わります。freeeが初期提案する税区分をそのまま採用せず、自社方針を税理士へ確認してください。

部分入金

請求額10万円のうち6万円だけ入金された場合、一部入金として6万円の決済を登録し、残り4万円を未決済として残します。

手動消込では手数料扱いのチェックを外し、今回受け取った額だけを登録しましょう。「自動で経理」の一部入金でも、明細金額と今回の決済額を一致させる操作です。

複数請求をまとめて入金

3件の請求合計30万円が一括入金された場合、対象の未決済取引すべてを選び、合計を銀行明細へ合わせます。

一つの請求へ30万円全額を入れると、他の請求が未決済のまま残り、対象請求が過入金になります。

源泉所得税が差し引かれた

報酬等から源泉所得税が差し引かれた場合、差額調整で事業主貸・仮払税金等の適切な科目を使います。支払手数料として登録しません。

対象報酬、税額、復興特別所得税、法人・個人の違いを支払明細と専門家確認で確定します。

原因不明・過入金

原因が分からない差額や請求額を超える入金は、売上や雑収入へ即時確定せず、仮受金等で一時処理する方法を検討します。取引先へ照会し、返金・次回相殺等が確定してから振り替えます。

売掛金の回収状況と残高ずれを確認する

入力後は、未決済一覧、売掛レポート、試算表、銀行残高を役割別に確認します。

未決済取引一覧

個別請求の回収状況を調べる入口は、未決済取引一覧です。決済期日を過ぎた取引に絞り、取引先と金額から連絡対象を選びましょう。

売掛レポート

freeeの売掛金管理ガイドでは、売掛レポートから未入金の売掛金や取引先別残高を年齢表形式で確認できると案内されています。

期限別に管理する方法は売掛金のエイジング管理も参考にしてください。

試算表・総勘定元帳

会計上の売掛金合計と増減を確認します。未決済一覧の合計と売掛金残高が合わない場合、直接仕訳、開始残高、インポート、振替等を調査します。

銀行残高

freee上の銀行口座残高と実際の通帳・ネットバンキングを照合します。明細の無視、重複登録、口座振替の誤りがあると、売掛金消込が正しくても預金残高は合いません。

売掛金残高が合わない原因

freeeでは会計仕訳と未決済ステータスの両方があるため、どちらがずれているかを切り分けます。

未決済取引へ決済を登録せず直接仕訳した

普通預金／売掛金の仕訳だけを登録すると、売掛金残高は減っても未決済取引が残る場合があります。元の取引へ決済を登録する方法へ直せるか、公式サポートへ確認します。

売上・請求書を二重登録した

請求書から作った取引と、手動の収入取引が重複すると売掛金と売上が二重になります。発生日、金額、取引先、備考を検索します。

入金を二重登録した

手動決済後に銀行明細も取引登録すると、入金が二重になります。銀行明細は元の未決済取引へひも付けます。

別の取引先へ消し込んだ

同額請求やグループ会社の振込名義で、別取引先の未決済取引を選ぶことがあります。取引先別売掛残高のマイナス・滞留を確認します。

開始残高・年度またぎが誤っている

導入時の売掛金を開始残高と個別取引の両方へ入れると重複します。前年売上を当年へ再登録していないか、前期末残高と翌期首を照合します。

差額を手数料と誤認した

源泉所得税、一部入金、値引、相殺を支払手数料へ入れると、費用と売掛金の両方が誤ります。売掛金がマイナスになる原因に沿って、最初に残高が崩れた取引を調べます。

原因不明の調整仕訳で残高だけを合わせず、取引・決済・銀行明細のどこで重複または欠落したかを特定してください。

二重入力を防ぐ運用

日々の担当者が違っても同じ処理になるよう、登録元と月次締めを決めます。

売上の登録元を一つにする

請求書、外部連携、CSV、手入力のどれを正本とするか決めます。例外的な手入力にはメモタグを付けます。

取引先と請求番号を統一する

取引先マスタの重複を整理し、請求番号・対象月を備考へ残します。振込名義が異なる場合は取引先メモへ登録します。

自動登録ルールを定期点検する

税率、手数料、取引先、決済方法が変わったらルールを更新します。誤った自動登録を学習させないよう、月次で例外を確認します。

月末に4点照合する

• 請求書一覧
• 未決済取引・売掛レポート
• 売掛金元帳
• 銀行明細

件数と金額を取引先別に照合し、期限超過・小額残高・マイナス残高を調査します。

freee会計の売掛金入力に関するよくある質問

freee会計では売掛金を直接入力しますか？

通常の後払い売上は、収入取引を未決済で登録するとfreeeが売掛金を計上する仕組みです。入金は元の未決済取引へ決済として登録しましょう。売掛金科目の別取引だけを直接作ると、元取引の未決済残高が残る場合があります。

freee会計で売掛金の入金はどう登録しますか？

取引の一覧・登録から対象の未決済取引を選び、入金先口座、決済日、入金額を登録します。銀行明細を取り込んでいる場合は、自動で経理の未決済取引消込から対象請求へひも付けます。

請求書を作れば売掛金も登録されますか？

新しい帳票機能では、対象プランで［取引登録］または［保存して取引を登録］を使うと未決済取引が作成されます。請求書を保存しただけか、取引登録まで済んだかを確かめ、同じ売上を手入力で重ねないようにしましょう。

振込手数料を引かれた入金はどう処理しますか？

未決済取引の決済時に実入金額と差額を登録し、請求額全額を消し込みます。freeeには支払手数料として差額を追加する操作がありますが、売上返還か課税仕入れかで税区分が変わるため確認が必要です。

一部入金はどう登録しますか？

一部入金として今回の決済額だけを登録し、残額を未決済で残します。手数料扱いにしないようチェックを確認し、残額と次回入金予定日を管理してください。

売掛レポートと試算表が合わないのはなぜですか？

直接仕訳で売掛金を消した、請求書と手入力が重複した、決済を別取引先へ登録した、開始残高が重複した等が考えられます。未決済取引、仕訳帳、銀行明細を同じ取引先・日付・金額で照合します。

まとめ

freee会計の売掛金入力は、売上発生日に未決済の収入取引を登録し、入金時に元の取引へ決済を登録するのが基本です。これにより、売掛金仕訳と個別請求の回収状況を同時に管理できます。

手動消込・自動で経理のどちらでも、請求番号、取引先、入金額を照合してください。振込手数料、部分入金、複数請求、源泉所得税は理由別に処理し、月末に請求書・未決済一覧・売掛金元帳・銀行明細の4点を合わせます。

入金前に事業の支払いが来る場合は、必要額と不足する期間を整理しましょう。資金化を検討するなら、複数社の手数料・最終入金額・入金予定日を比べ、自社の期限に合う会社を選ぶことも必要です。

参考にした公的・公式情報

• freeeヘルプ「未決済取引を消込する」
• freeeヘルプ「売掛金や買掛金と入力せず未決済取引の決済で行う理由」
• freee「freeeで行う売掛金管理」
• freeeヘルプ「取引登録方法に関するよくある質問」